Навчально-виховний процес на Станції юних натуралістів здійснюється за типовими навчальними планами і програмами, що затверджуються МОН, а також за навчальними планами і програмами, затвердженими управлінням освіти Стрийської міської ради Стрийського району Львівської області.
Станція юних натуралістів проводить навчально-виховну, організаційно-масову та методичну роботу диференційовано (відповідно до віку, індивідуальних можливостей, інтересів, нахилів, здібностей, стану здоров’я вихованців) з використанням різноманітних організаційних форм роботи: заняття, гурткова робота, клубна робота, урок, лекція, індивідуальні заняття, конференція, семінар, читання, вікторина, екскурсія, експедиція, практична робота в лабораторіях, теплицях, на навчально-дослідній земельній ділянці в природі.